类器官靶点验证
一、疾病相关模型
对疾病生物学的理解,是靶点发现和验证的基础。人源肿瘤模型(Patient-derived models)是从人疾病组织建立的疾病模型,具有更好的临床疾病相关性,是靶点发现和验证的理想平台。典型的人源模型包括PDC,PDO,PDX。
二、靶点表达分析
在人源疾病模型中,开展靶点和标志物分析,验证靶点在特定疾病中的表达特征。在人源模型,不仅可以通过免疫印迹(Western blot)、RT-PCR、RNA-seq,WES等分析靶点和标志物表达,还可以和临床信息和表型检测数据建立关联。
三、表型和功能性检测方法
在人源疾病模型中,可以建立表型检测方法和功能性检测方法。表型检测方法包括细胞增殖检测、细胞老化检测、细胞凋亡检测等。功能性检测包括磷酸化检测、报告基因检测等。
四、高通量靶点筛选
人源模型中,PDC和PDO可以实现高通量药物和靶点筛选。在384或96孔,结合小分子化合物文库、shRNA文库、cDNA文库等靶点干预方法,在全基因组水平筛选抗癌靶点。
五、靶点敲低和过表达
在类器官模型中,表达靶点蛋白或者shRNA是常见的药物类似物,验证特定靶点在人源模型中对肿瘤发生发展的重要性。
六、多组学分析
人源肿瘤类器官模型结合多组学分析可以有效提高靶点发现和验证的效率。全基因组测序(WGS),全外显子测序(WES)、表达谱分析(RNA-seq)、磷酸化质谱分析和原位质谱成像等。
对疾病生物学的理解,是靶点发现和验证的基础。人源肿瘤模型(Patient-derived models)是从人疾病组织建立的疾病模型,具有更好的临床疾病相关性,是靶点发现和验证的理想平台。典型的人源模型包括PDC,PDO,PDX。
二、靶点表达分析
在人源疾病模型中,开展靶点和标志物分析,验证靶点在特定疾病中的表达特征。在人源模型,不仅可以通过免疫印迹(Western blot)、RT-PCR、RNA-seq,WES等分析靶点和标志物表达,还可以和临床信息和表型检测数据建立关联。
三、表型和功能性检测方法
在人源疾病模型中,可以建立表型检测方法和功能性检测方法。表型检测方法包括细胞增殖检测、细胞老化检测、细胞凋亡检测等。功能性检测包括磷酸化检测、报告基因检测等。
四、高通量靶点筛选
人源模型中,PDC和PDO可以实现高通量药物和靶点筛选。在384或96孔,结合小分子化合物文库、shRNA文库、cDNA文库等靶点干预方法,在全基因组水平筛选抗癌靶点。
五、靶点敲低和过表达
在类器官模型中,表达靶点蛋白或者shRNA是常见的药物类似物,验证特定靶点在人源模型中对肿瘤发生发展的重要性。
六、多组学分析
人源肿瘤类器官模型结合多组学分析可以有效提高靶点发现和验证的效率。全基因组测序(WGS),全外显子测序(WES)、表达谱分析(RNA-seq)、磷酸化质谱分析和原位质谱成像等。
类器官血管生成试剂盒